делал ТАК :
Прогреваеш двигатель,свыше 80 градусов,глушиш,включаеш зажигание,подключаеш ваг ком,опрашиваеш ошибки (если есть стираеш),заходиш в адаптацию по нолевому каналу сбиваеш адаптации в заводские,заходиш в заводские установки выбираеш канал 001 и жмеш запуск, ждеш минуту -две,выходиш из контролера,выключаеш зажигание.
И запускаем апарат, желательно после этого, проехать на авто в разных режимах...